印度尼西亚政府除了对购房者征收房产购置税及附加税、奢侈品税外，还会每年灵活地对房产拥有者征收房产税。
雅加达税务局官员阿卜杜拉日前告诉记者，在印尼，房产税是由地方政府负责征收的，征收上来的税款将直接充入地方政府预算，支持地方建设。房产税是地方财政的重要来源之一，很受地方政府重视。
根据印尼法律，地方政府可以每年自行估计辖区各处房产的价值，然后在此基础上按一定比例收取房产税。出于照顾低收入阶层的原则，印尼政府对价值在１０亿印尼盾（约合１１．１万美元）以下的房产每年征收政府估价０．１％的房产税，而对其他房产则征收政府估价０．２％的房产税。
政府估价是地方政府在征收房产税时最灵活的工具。据在巴厘岛从事房地产业的印尼华人庄子勇介绍，印尼各地政府对于房产的估价并没有透明的标准，但一般来说，政府估价是当年房产市场价格的八成到九成。他说，由于近年来印尼房地产市场日益火爆，政府对房产的估价也是连年上涨，导致房产拥有者们每年要缴纳的房产税越来越高。
此外，印尼租房者一般来说需要代替房产拥有者支付每年的房产税，但这只是双方协议形成的约定，一些租房者会把房产税放在租金中一起交给房产拥有者。同时，雅加达部分廉租房的租户情况稍有不同。根据当地法规，政府将部分廉租房交给开发商进行建设，廉租房建成后５年内，租住住户可以免缴房产税，而由开发商承担；但在５年之后，该套房产的产权将被转移至开发商手中。
