此外，房地产税种设立后，现有税种也将进行调整。此前，国务院发展研究中心研究员倪红日曾表示，房地产税改革要把现有的房产税和城镇土地使用税合并起来。这则意味着，房地产税将增加房地产保有环节的税负，而且是以房地产的评估值为征税基础，其他诸如土地增值税、契税等暂不纳入。
“按照当前的房地产税思路，无论是合并税种，还是设置起征点，都需执行分步走的试行方式。在合并税种方面，初期仍需空转，征收对象也将从小范围入手，或从对经营生产性物业征收先行试点。而在面向住宅的房地产税征收上，也将从少数城市试点后再逐步推开。”上述东部某省财税系统内部人士指出。
值得玩味的是，地方政府对房地产税征收工作热情不高。此前华远地产(6.37,
-0.06,-0.93%)前董事长任志强[微博]曾公开表示，试点房产税的上海、重庆两个城市并没有获益，重庆甚至有“亏本”之嫌。
中国社科院城乡建设经济系主任、住建部政策研究中心原主任陈淮[微博]也曾公开判断，重庆和上海的房产税试点基本可以判断为失败，其主要依据就是房产税试点对两地房价的抑制作用并不明显，也无法降低地方政府对土地出让金的依赖。
为此，当房地产税被纳入税制改革要求快速推进后，地方政府则表现出动力不足的特点。此前，财政部曾要求地方根据当地情况提交针对征收房地产税的建设性意见，但只有湖南、湖北等省上交了试点方案，其他多数地方都“按兵不动”。
另外，由国土部负责推进的不动产登记制度一直被认为是“为开征房地产税铺路”的基础性政策，而这项工作在目前的落地实施中也遇到了难以推进的阻碍。
独立经济学家吴思捷指出，房产税改革方向是减少房产建设和交易环节税费，增加保有环节税收，配套推进清费立税。这项税改工作牵涉众多，只能慢慢推进。同时，由于房地产税的降房价作用曾被“妖魔化”，因此政府也需要在一定程度上纠正这一观念。
“房地产税起码两年内不可能落地。”中原地产首席分析师张大伟分析认为，房地产市场经过一年的调整，近期才相对稳定，同时宏观经济层面仍需要房地产行业的带动作用，因此短期内不可能出台相关的制度变化。
事实上，房地产税牵涉到整个土地税收，如果征收房地产税，可能就要对比如土地出让中的很多收费标准进行调整。而土地出让金作为地方政府的主要财政来源，一般占地方财政收入的1/3，在个别地方甚至达一半以上。如果土地出让金并入物业税中分期支付，则难免会触动地方利益。
